Sur la Durance, dans l'Orne, le plan d'eau des Landes formait un véritable labyrinthe hydraulique rendant le cours d'eau totalement infranchissable. Sur cette rivière classée en listes 1 et 2, la Fédération de pêche de l'Orne a porté un projet de bras de contournement.
Sur la Rhône, affluent de l'Huisne aux confins de l'Orne et de l'Eure-et-Loir, deux ouvrages condamnaient la circulation de la truite fario et de l'anguille européenne. La Fédération de pêche d'Eure-et-Loir a démantelé le vannage de la Pitarnière, dont le droit d'eau avait été abrogé en 2016, pour restaurer la continuité écologique du cours d'eau.
La crue de juin 2016 a eu raison du moulin de l'Écluse, sur l'Eure : vanne détruite, ouvrage resté ouvert plus d'un an, baisse de la ligne d'eau et rétrécissement du lit. Le nouveau propriétaire favorable à l'abrogation du droit d'eau, la Fédération de pêche d'Eure-et-Loir a restauré 700 mètres de cours d'eau.
Sur la Selle, réservoir biologique réputé pour sa truite fario et sa lamproie de Planer, le moulin de Saint-Martin-Rivière a disparu depuis longtemps, mais son seuil est resté dans le lit, perturbant la rivière 250 ans après sa construction. La Fédération de pêche de l'Aisne a engagé un bras de contournement pour rétablir la dynamique naturelle du cours d'eau.
Étiages sévères, assecs récurrents, débits en chute : les cours d'eau de l'Aisne subissent de plein fouet le dérèglement climatique. Pour concilier bon état écologique et usages agricoles, industriels et urbains, la Fédération de pêche a entrepris de mesurer des débits biologiques d'étiage, une donnée quasi absente du département.
Sur le domaine du château des Ravalet, près de Cherbourg, le Trottebec alimentait depuis des siècles les douves via un bief dérivé, au prix d'une continuité écologique compromise par plusieurs ouvrages abandonnés. Vingt ans de réflexion ont abouti en 2020 à un projet porté par la Fédération de pêche de la Manche : concilier circulation piscicole et patrimoine classé.
Dans les marais du Cotentin, le vannage du Pont de l'Acre bloquait la remontée de l'anguille et du brochet dans le canal de l'Esque, malgré son rôle essentiel pour l'agriculture et la chasse locales. La Fédération de pêche du Calvados, propriétaire d'une parcelle voisine dédiée à une frayère à brochet, a créé une rivière de contournement avec passe à poissons.
Étiages, chute de l'oxygène dissous, disparition de la truite fario et de l'écrevisse à pattes blanches : le changement climatique bouleverse les équilibres thermiques des cours d'eau. La Fédération de pêche du Loiret a lancé en 2024 un réseau de suivi thermique à l'échelle du département.
En mars 2015, la rupture accidentelle du clapet de Soignolles-en-Brie a fait chuter le niveau de l'Yerres d'1,50 m sur 2 km : berges dénudées, vase accumulée, annexes hydrauliques déconnectées. La Fédération de pêche de Seine-et-Marne a engagé un diagnostic complet et une restauration sur 1,5 km de cours d'eau.
Aux abords de la réserve naturelle de Vesles-et-Caumont, la Souche et son marais tourbeux abritent des espèces piscicoles précieuses et encore méconnues. La Fédération de pêche de l'Aisne y a lancé en 2024 une étude scientifique de trois ans, pour comprendre leur cycle de vie et la résilience du site face aux sécheresses.
