Le 3 août 2018, un déversement massif de vinasse depuis une usine d'Origny-Saint-Benoîte a provoqué une anoxie sur plusieurs kilomètres de l'Oise, tuant l'ensemble des espèces piscicoles jusqu'à la confluence avec la Serre. La Fédération de pêche de l'Aisne a engagé une procédure judiciaire et obtenu la restauration de deux annexes hydrauliques en réparation.
En septembre 2019, le déversement de 20 000 litres d'azote près de Vauxbuin a provoqué une mortalité piscicole massive sur la Crise, cours d'eau déjà fragilisé. En réparation, la Fédération de pêche de l'Aisne a restauré les tronçons touchés et l'annexe hydraulique adjacente, pour reconstituer les habitats de reproduction et d'alimentation.
À Ménilles, un fossé du lit majeur de l'Eure présentait toutes les caractéristiques d'une frayère à brochet, mais un merlon vaseux le déconnectait totalement du cours d'eau, y compris en crue, risquant de piéger les poissons plutôt que de les accueillir. Après une étude en 2021-2022, la Fédération de pêche de l'Eure a restauré cette zone humide.
Créé au XIIIe siècle et labellisé Espace Naturel Sensible en 2016, l'étang de Marcenay, en Côte-d'Or, est cogéré par le Conservatoire des Espaces Naturels de Bourgogne et la Fédération de pêche, selon une approche patrimoniale peu interventionniste. Une vidange périodique, tous les quatre à cinq ans, joue un rôle clé dans l'équilibre écologique du site.
Le brochet, carnassier au cycle biologique particulier, doit accéder à une frayère fonctionnelle et connectée au cours d'eau pour se reproduire. C'est pour restaurer cette continuité que la Fédération de pêche de l'Aisne a engagé la restauration de la frayère d'Aulnois.
Les géniteurs de brochets se reproduisent dans des zones humides fonctionnelles, connectées au cours d'eau et submergées une partie de l'année, mais l'anthropisation des milieux aquatiques a fait perdre cette connectivité à plusieurs zones alluviales de l'Aube et de la Seine, aujourd'hui restaurées.
Depuis le début du XXe siècle, 67 % des zones humides ont disparu en France métropolitaine, alors que ces écosystèmes sont essentiels à l'équilibre fluvial, à la qualité de l'eau et à la vie des espèces. À Brissy-Hamégicourt, dans l'Aisne, une annexe hydraulique a été restaurée pour inverser cette tendance.
Depuis le début du XXe siècle, la disparition des zones humides est estimée à 67 % en France. Le brochet, qui fréquente ces annexes alluviales pour se reproduire, en pâtit particulièrement. Sur l'Ourcq, dans l'Aisne, la Fédération de pêche a restauré une frayère pour l'espèce.
L'Armance, cours d'eau de seconde catégorie piscicole dont le brochet est l'espèce repère, a besoin de zones humides fonctionnelles pour la reproduction de l'espèce. La Fédération de pêche de l'Aube a restauré la continuité latérale entre le cours d'eau et une frayère à Avreuil.
Classé « vulnérable » sur la liste rouge de l'UICN, le brochet décline notamment à cause de la disparition de ses zones de reproduction, où il pond sur un substrat enherbé et peu profond. La Fédération de pêche de la Marne a restauré la zone humide du moulin de Chaudefontaine pour ce type d'habitat.
