La Durdent, fleuve côtier de Seine-Maritime classé en liste 2, doit voir ses ouvrages gérés et équipés pour assurer le transport des sédiments et la circulation des poissons migrateurs. Un ancien site de pisciculture à Héricourt-en-Caux constituait justement un obstacle à cette continuité, aujourd'hui restauré.
Depuis le début du XXe siècle, la disparition des zones humides est estimée à 67 % en France. Le brochet, qui fréquente ces annexes alluviales pour se reproduire, en pâtit particulièrement. Sur l'Ourcq, dans l'Aisne, la Fédération de pêche a restauré une frayère pour l'espèce.
Le Rû du Vigneux, affluent rive droite de la Serre dans l'Aisne, a été identifié comme ruisseau pépinière pour la reproduction d'espèces de première catégorie, notamment la truite fario, qui se reproduit dans des zones peu profondes à courant modéré. Une restauration hydromorphologique y a été engagée.
La continuité écologique, c'est la libre circulation des poissons et des sédiments, mise à mal par la présence de barrages ou de buses sur les cours d'eau. Pour la rétablir sur la Soude et la Somme-Soude, un projet de restauration a été engagé dans la Marne.
L'Armance, cours d'eau de seconde catégorie piscicole dont le brochet est l'espèce repère, a besoin de zones humides fonctionnelles pour la reproduction de l'espèce. La Fédération de pêche de l'Aube a restauré la continuité latérale entre le cours d'eau et une frayère à Avreuil.
Le ruisseau du Vivier, de première catégorie piscicole, présente une bonne qualité d'eau, mais le piétinement régulier du bétail dégrade son hydromorphologie : érosion des berges, absence de ripisylve, incision du lit. Un projet de restauration a été engagé à Andelot-Blancheville, en Haute-Marne.
La Laigne, cours d'eau de Côte-d'Or, a connu comme beaucoup de rivières françaises des actions de curage et de recalibrage, qui ont banalisé son lit et raréfié les habitats disponibles pour les poissons. Un projet de restauration hydromorphologique y a été engagé.
En France métropolitaine, un ouvrage bloquant la continuité écologique est recensé en moyenne tous les 5 km de cours d'eau. À Esquéhéries, dans l'Aisne, la Fédération de pêche a engagé l'effacement du seuil du moulin pour rétablir la continuité sédimentaire et piscicole du cours d'eau.
Classé « vulnérable » sur la liste rouge de l'UICN, le brochet décline notamment à cause de la disparition de ses zones de reproduction, où il pond sur un substrat enherbé et peu profond. La Fédération de pêche de la Marne a restauré la zone humide du moulin de Chaudefontaine pour ce type d'habitat.
En automne, les géniteurs de truite fario remontent les cours d'eau à la recherche de frayères peu profondes, à courant modéré, sur un substrat de graviers et de cailloux. Sur l'Ourcq, dans l'Aisne, l'habitat salmonicole a été restauré pour retrouver ces conditions de reproduction.
